Questionado sobre a posição do Papa Francisco em relação aos homossexuais – “Quem sou eu para julgá-los?” – o novo cardeal espanhol respondeu, em entrevista ao Sur, de Málaga, que “uma coisa é acolher e mostrar afeto a uma pessoa homossexual e outra é legitimar o exercício da homossexualidade.”
“Com todo o respeito, digo que a homossexualidade é uma forma deficiente de manifestar a sexualidade, porque esta tem uma estrutura e um fim, que é o da procriação”, afirmou o arcebispo emérito de Pamplona, antes de insistir na ideia da deficiência: “Temos várias deficiências no nosso corpo. Eu tenho hipertensão. Vou aborrecer-me se mo disserem? É uma deficiência que tenho de corrigir como puder.”
Fernando Sebastián faz parte do primeiro grupo de novos cardeais designados por Francisco.